Флуконазол обычно хорошо переносится. Отмечено, что частота побочных лекарственных реакций достоверно выше в популяции больных СПИДом.
Со стороны нервной системы: головная боль, головокружение, судороги.
Со стороны пищеварительной системы: изменение вкуса, тошнота, рвота, диарея, метеоризм, абдоминальные боли, нарушение функции печени (повышение активности щелочной фосфатазы, билирубина, сывороточной активности аминотрансфераз, гепатит, гепатоцеллюлярный некроз, в том числе с летальным исходом).
Со стороны сердечно-сосудистой системы: увеличение продолжительности интервала Q-T, мерцание/трепетание желудочков.
Со стороны органов кроветворения: тромбоцитопения, лейкопения, нейтропения, агранулоцитоз.
Со стороны мочевыделительной системой) почечная недостаточность.
Аллергические реакции: кожная сыпь, синдром Стивенса-Джонсона, токсический эпидермальный некролиз, анафилактоидные реакции.
Прочие:нарушение функции почек, алопеция, гиперхолестеринемия,
гипертриглицеридемия, гипокалиемия.